【宏基因组学】帮你擦亮双眼,慧眼识“菌”

时间:2019-09-19

组学研究的火热最初是由基因组学开始,然后是蛋白质组学、代谢组学;随着基因测序技术的迅猛发展,基于二代测序的宏基因组测序(mNGS)渐渐成为了临床的焦点。那么今天小编将带你们慧眼识“菌”,来了解一下宏基因组学。


宏基因组 ( Metagenome)(也称微生物环境基因组Microbial Environmental Genome, 或元基因组)是由 Handelsman 等 1998 年提出的新名词,即环境中全部微生物遗传物质的总和。

宏基因组学(Metagenomics),一般指通过直接从特定生态环境样品中提取全部微生物的DNA,进行高通量测序分析,研究环境微生物的群落结构、物种分类、系统进化、基因功能、代谢网络及与其所在的生态环境间的互作情况等的一门学问。


技术路线

测序策略

生信分析

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菌群分布结果:

物种丰度热图:

KEGG分类结果:

服务周期

样本质控合格后30个工作日


参考文献

[1]Petersen Lauren M,Bautista Eddy J,Nguyen Hoan,Hanson Blake M,Chen Lei,Lek Sai H,Sodergren Erica,Weinstock George M. Community characteristics of the gut microbiomes of competitive cyclists.[J]. Microbiome,2017,5(1).



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