一站式RNA-seq 青莲给您不一样的冰爽酷感

时间:2019-08-05

“三伏天”过去一半了,这个夏天,您不仅有空调WIFI西瓜作伴,还有我们青莲人的热忱服务一路相伴,青莲百奥作为“宠研狂魔”必须给您满满的爱来度过燥热的夏天!为此我们又隆重推出RNA-seq服务,为客户提供科研一条龙服务,让您不再为了科研“跑断腿”。


转录组指的是特定细胞在某一状态下所有转录产物的集合,包括了编码的mRNA和非编码RNA,例如lncRNA,miRNA,circRNA等下面小编就来介绍下普通转录组mRNA测序服务。


产品简介

   普通转录组测序就是对特定物种或者特定细胞在某一功能状态下产生的所有mRNA进行的测序。将生物样本中的RNA反转录为cDNA,构建测序文库,利用二代测序平台得到序列,进行生物信息学分析;全面快速地获得某一物种特定组织在某一状态下的所有转录本。


技术路线

注:真核生物采用Oligo dT磁珠富集法,原核生物采用去rRNA法来富集mRNA。


技术优势

  检测不受物种限制:不依赖于参考基因组,对于无参基因组的物种也可以进行转录组测序以及后续分析

  检测范围广泛:可直接对任意物种进行转录组测序,可以同时鉴定己知的、稀有低丰度的和新的转录本

  高质量数据产出:实验过程中严格按照质控标准,保证数据可靠性。测序结果精确到单个碱基,可检测到由可变剪切造成的单个碱基差异。

  资深的生信分析团队 :测序数据可被用来分析基因表达差异,基因功能分析以及鉴定新的转录木信息以及个性化分析

  优质的一站式股务:专业的技术团队为您提供1V1的一站式服务,让您时刻了解项目动态。 

 

测序策略

样本要求

数据分析

  根据测序物种有无参考基因组可以分为有参转录组测序无参转录组测序分别可以得到的生信分析如下:



  有参转录组测序生信分析:




无参转录组生信分析


部分数据展示:


组间的差异基因 Venn


差异表达基因聚类热图


样品 PCA 分析图



差异基因 GO Terms 富集结果 top20 散点图




  想要跟多生信分析结果,也可联系我们,跟多私人定制化分析等您来体验!

  服务周期:样本质检合格后30个工作日。



参考文献


[1]Huang Yingmei,Chen Huiqiong,Reinfelder John R,Liang Xiaoyu,Sun Chongjun,Liu Chuanping,Li Fangbai,Yi Jicai. A transcriptomic (RNA-seq) analysis of genes responsive to both cadmium and arsenic stress in rice root.[J]. The Science of the total environment,2019,666.

[2]Kundu Anirban,Singh Pankaj Kumar,Dey Avishek,Ganguli Sayak,Pal Amita. Complex molecular mechanisms underlying MYMIV-resistance in Vigna mungo revealed by comparative transcriptome profiling.[J]. Scientific reports,2019,9(1).

[3]Yan Yong-Wei,Zou Bin,Zhu Ting,Hozzein Wael N,Quan Zhe-Xue. Modified RNA-seq method for microbial community and diversity analysis using rRNA in different types of environmental samples.[J]. PloS one,2017,12(10).

[4]Peng Wu,Shuo Yang,Sandeep Singh,Fujun Qin,Shailesh Kumar,Ling Wang,Ding Ma,Hui Li. The Landscape and Implications of Chimeric RNAs in Cervical Cancer[J]. EBioMedicine,2018,37

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